Wirom to całkowity zbiór wirusów utrzymujących nas przy życiu.

De facto to ogrom cząstek zawierających informacje, którymi komórki komunikują się między sobą.

Bez wiromu nie mogli byśmy żyć, a patogenność tych cząsteczek jest stricte uznaniowa…

„Charakterystyka wiromu krwi jest ważna dla bezpieczeństwa produktów transfuzji krwi oraz dla identyfikacji pojawiających się patogenów. Zbadaliśmy dane sekwencji innych niż ludzkie z sekwencjonowania całego genomu krwi od 8240 osób, z których żadna nie została potwierdzona pod kątem jakiejkolwiek choroby zakaźnej. Sekwencje wirusowe zostały wyekstrahowane z puli odczytów sekwencji, które nie były mapowane na ludzki genom referencyjny. Analizy przeszukały prawie 1 petabajt danych sekwencji i przeprowadziły 0,5 biliona wyszukiwań podobieństw. Z dolną granicą identyfikacji 2 genomów wirusowych / 100 000 komórek, zmapowaliśmy sekwencje do 94 różnych wirusów, w tym sekwencje z 19 ludzkich wirusów DNA, prowirusów i wirusów RNA (herpeswirusy, anellowirusy, wirusy brodawczaka, trzy poliomawirusy, adenowirus, HIV, HTLV, wirusowe zapalenie wątroby typu B, wirusowe zapalenie wątroby typu C, parwowirus B19, i grypy) u 42% uczestników badania. Możliwe znaczenie dla medycyny transfuzyjnej zidentyfikowaliśmy poliomawirusa komórek Merkla u 49 osób, wirusa brodawczaka we krwi 13 osób, parwowirusa B19 u 6 osób i obecność wirusa opryszczki u 8 osób. Obecność sekwencji DNA z dwóch wirusów RNA była nieoczekiwana: wirus zapalenia wątroby typu C ujawnia zdarzenie integracyjne, podczas gdy sekwencja wirusa grypy powstała w wyniku immunizacji szczepionką DNA. Wiek, płeć i pochodzenie znacząco przyczyniły się do rozpowszechnienia infekcji. Pozostałe 75 wirusów w większości odzwierciedla rozległe zanieczyszczenie odczynników handlowych i ze środowiska. Te problemy techniczne stanowią główne wyzwanie dla identyfikacji nowych ludzkich patogenów. Rosnąca dostępność sekwencji całego genomu ludzkiego dostarczy znacznych ilości danych na temat składu normalnego i patogennego wiromu ludzkiej krwi. Odróżnienie zanieczyszczeń od prawdziwych ludzkich wirusów jest trudne.”

Podsumowanie autora:

Nowe technologie sekwencjonowania zapewniają wgląd w wirom w próbkach ludzkich. Tutaj identyfikujemy wirusowe sekwencje DNA we krwi ponad 8 000 osób poddawanych sekwencjonowaniu całego genomu. To podejście służy do identyfikacji 94 wirusów; jednak wykazano, że wiele z nich odzwierciedla powszechne zanieczyszczenie DNA odczynników handlowych lub pochodzenia środowiskowego. Chociaż stanowi to znaczne ograniczenie w niezawodnej identyfikacji nowych wirusów infekujących ludzi, mogliśmy z pewnością wykryć sekwencje i określić ilościowo liczebność 19 ludzkich wirusów u 42% osobników. Pochodzenie, płeć i wiek były ważnymi wyznacznikami rozpowszechnienia wirusa. To duże badanie zwraca uwagę na wyzwanie, jakim jest interpretacja danych sekwencjonowania nowej generacji w celu identyfikacji nowych wirusów”